Per la tutela della trota mediterranea nativa Salmo cettii, Stato e Regioni hanno istituito sul territorio italiano alcuni Siti di Interesse Comunitario/Zone Speciali di Conservazione per i quali vengono definiti obiettivi e misure che ne garantiscano il mantenimento e/o il miglioramento dello stato di conservazione.
Le 6 aree pilota nelle quali il progetto STREAMS opera si trovano presso:
- Il Parco Nazionale della Majella – PNM
- Il Parco di Montemarcello-Magra-Vara – PMAGRA
- Il Parco Nazionale delle Foreste Casentinesi, Monte Falterona e Campigna – PNFC
- Il Parco Nazionale dei Monti Sibillini – PNMS
- Il Parco Nazionale del Pollino – PNP
- La regione Sardegna
In ciascuna di queste aree insistono molteplici SIC/ZSP di Natura 2000, per un totale di 36, all’interno dei quali sono identificati i vari siti di campionamento e di conservazione per le azioni del progetto.